Eine Form der Arbeit im Versöhnungsbund sind die sogenannten Kommissionen. Dies sind Gruppen, die an einzelne Themen, die dem VB wichtig sind, kontinuierlich arbeiten.
Manche von ihnen treffen sich mehrmals im Jahr und bereiten auch Einheiten für die Jahrestagung vor. Eine Mitarbeit steht auch weiteren Personen offen, von daher sind sie auch eine Gelegenheit den Versöhnungsbund kennenzulernen.
Zurzeit sind insbesondere folgende Kommissionen aktiv:
- die Beloved Communities Kommission (Anti-Rassismus-Arbeit)
- die Kommission Friedensbildung
- die Anti-Atomwaffen-Kampagnenkommission
- die Kommission Friedenstheologie
- die Kommission zur Gewaltfreien Kommunikation
- die Gender-Kommission
- die Indien-Kommission
- die Kommission Westasien - Israel/Palästina
- die IFOR-Kommission
- die Kommission Leben in Gerechtigkeit — Umwelt-, Wirtschafts- und Sozialökologie
- und der Arbeitskreis Friedensauftrag und Militär